2013年，瑞士的原子核研究机构“CERN”——
在希格斯玻色子这一发现的暗影之下，某个秘密计划启动了。
这一计划的名称是“Niantic计划”。
其目的是研究干涉人类精神的未知物质。
被称为“奇异物质（XM）”的这种物质，
自古以来就感应着人们的精神及能力，甚至给人类的历史带来了极大的影响。
世界各国的机关暗中进行着这项研究。
XM被视为人类的希望或是威胁，
大国及巨大企业为此而爆发了争夺战。
接受XM的力量，并准备将其利用于人类进化的“启蒙军”。
将XM视为威胁，并准备控制它的“反抗军”。
世界划分为这两大阵营，至今仍在持续着争斗。
在这个世界发生的争斗背后，正是XM的存在。
之后，2018年——。
以东京和世界为舞台，围绕着XM的新战斗开幕。
将动画、在线位置信息游戏以及现实连结起来，
从未体验过的全新“增强现实娱乐”开始了。